Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms