Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBQLN2Q9UHD9 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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