Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MIS18AQ9NYP9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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