Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms