Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXF3Q9H4D5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms