Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms