Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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