Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCD1Q6ZMY3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms