Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms