Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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