Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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