Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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