Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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