Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms