Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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