Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBRQ0VD83 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms