Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LINC00313P59037 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms