Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNA2P20248 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms