Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TSPAN8P19075 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms