Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSF2P04141 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSF2P04141 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms