Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT34O76011 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT34O76011 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT34O76011 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT34O76011 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT34O76011 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT34O76011 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT34O76011 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT34O76011 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT34O76011 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT34O76011 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms