Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DENRO43583 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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