Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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