Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PATL2C9JE40 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms