Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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LINC00587B1AMM8 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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