Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NOTOA8MTQ0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms