Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IGSF9BQ9UPX0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms