Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1Q9UJ41 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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