Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms