Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms