Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms