Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC114Q96M63 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms