Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf72Q96LT7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms