Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STAMBPL1Q96FJ0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STAMBPL1Q96FJ0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms