Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms