Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATL2Q8NHH9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms