Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLGN4YQ8NFZ3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms