Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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