Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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PTPRNQ16849 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PTPRNQ16849 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PTPRNQ16849 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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