Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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