Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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