Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms