Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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