Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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