Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CUL4AQ13619 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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