Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms