Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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KCNMA1Q12791 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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