Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE3AQ05086 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms