Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAP2Q03519 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms