Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CENPEQ02224 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms